Tomografia eli kerroskuvaus mahdollistaa elimistön sisäisten rakenteiden ja toiminnan tutkimisen ilman kirurgisia toimenpiteitä. Potilaalle tutkimus saattaa näyttäytyä lähinnä kuvantamislaitteessa makaamisena ja lääkärit tulkitsevat valmiita kuvia diagnosoidessaan sairauksia.
Valmiin kuvan taustalla on kuitenkin monimutkainen laskennallinen prosessi. Kuvaa ei mitata suoraan, vaan havaitaan ainoastaan gammafotoneja potilaan ympäriltä. Transmissiotomografiassa, esimerkiksi tietokonetomografiassa (TT) fotonit ovat peräisin röntgenputkesta, ja emissiotomografiassa, kuten SPET- ja PET-tutkimuksissa, fotonit ovat peräisin potilaan elimistössä hajoavasta radioaktiivisesta merkkiaineesta.
Emissiotomografiassa haasteena on päätellä havaittujen fotonien perusteella, kuinka merkkiaine on jakautunut potilaan elimistöön. Käytännössä etsitään sellaista kuvaa, joka todennäköisimmin selittää havaitut fotonit. Koska potilaan säteilyaltistus pyritään pitämään mahdollisimman pienenä, havaittujen fotonien määrä on hyvin rajallinen. Mitä vähemmän fotoneja havaitaan, sitä vaikeampaa on muodostaa tarkka ja luotettava kuva. Toisaalta rekonstruktiomenetelmiä kehittämällä riittävän tarkka kuva voidaan kuitenkin muodostaa yhä pienemmästä määrästä fotoneja. Tämä puolestaan vähentää potilaan säteilyaltistusta.
Työssä kehitetään avoimen lähdekoodin OMEGA-rekonstruktio-ohjelmistoa erityisesti yksifotoniemissiotomografian (SPET) näkökulmasta tukemaan väitöskirjatyössä kehitettäviä menetelmiä.
Niilo Saarlemo sai Fuugin säätiöltä 5 000 euron apurahan avoimen lähdekoodin OMEGA-ohjelmiston kehittämiseen, jonka tavoitteena on tuottaa tarkempia lääketieteellisiä tomografiakuvia pienemmällä säteilyannoksella.
Fuugin säätiö jakaa apurahoja avointen tietojärjestelmien ja avoimen lähdekoodin ohjelmistojen kehittämiseen liittyvään työhön. Säätiön jatkuvaan apurahahakuun voi jättää hakemuksen milloin tahansa. Sama hakija tai hanke voi myös hakea avustusta useita kertoja.