Breeze 2.0: verkkosovellus lääkeseulonnan tulosten interaktiiviseenanalysointiin ja visualisointiin

Breeze 2.0 verkkosovelluksella voidaan analysoida lääkeseulonnan tuloksia ja suorittaa seulonnan laadunvalvontaa, tulkita tunnistettuja lääkeosumia väärien positiivisten/negatiivisten löytämiseksi, sekä tehdä tulosten jälkianalyysia ja visualisoida tuloksia. Breeze 2.0- verkkosovellus julkaistiin Nucleic Acids Research –julkaisusarjassa 2023 (Nucleic Acids Research, Volume 51, Issue W1, 5 July 2023, Pages W57–W61, https://doi.org/10.1093/nar/gkad390). Julkaisulla on tähän mennessä 4 viittausta ja käyttäjämäärät ovat …

Lue lisää

Suomen romanikielen kieliteknologiaa valmistunut Linuxia hyödyntäen

18.2.2024 kirjoittaja Kimmo Granqvist ROMTWOL on Suomen romanikielen automaattisen muoto-opin jäsennin. Se etsii siihen syötetylle sananmuodolle sanavartalon tai perusmuodon, jonka hyväksyttävä muoto se on. Samalla se kertoo, millaisista osista sananmuoto koostuu. Esimerkiksi romanikielen sana ”džeeno” ’mies’ analysoidaan ”^džeeno/’džeen$<n><sg><nom>$”, jossa <n> tarkoittaa sanaluokkaa substantiivi, <sg> yksikköä ja <nom> nominatiivisijaa. Jäsennin ei löydä analyysiä väärin kirjoitetulle tai …

Lue lisää

Build or Die! Eeppinen, kevytmielinen ja omien sanojemme mukaan universumin kovin hackathon.

Hacklabit ovat ihmisiä ja tekemistä varten. Tämän vuoksi Hacklab Mikkeli päättikin tarjota yhteisöllisen ja halloween-teemaisen hackathon-hulluttelun paikalliselle värkkäilijäskenelle ja ihan kenelle vaan kiinnostuneelle, oli skenessä tai ei. Hackathonista kehitettiin viikon mittainen spektaakkeli. Ajatuksena oli, että rakenteluun ja koodaamiseen olisi riittävästi aikaa ja olisi viihdyttävää. Homma käynnistyi maanantaina 31.10 avajaisilla, jossa puhuttiin hackathonien olemuksesta, merkityksestä ja …

Lue lisää

Hacklab Mikkelin Craftlabissa yhdistettiin käsityöt ja koodaus

Syksyllä 2022 Hacklab Mikkeli ry:n tiloissa on kokoonnuttu arduinon ja käsityön luontevaan yhteistyöhön. Paja tavoitti uusia kävijöitä koodaamista aloittelevista ja myös kokeneita ohjelmoinnin soveltajia. Jokainen sai haastaa osaamistaan itse valitsemansa projektin parissa. Osallistujat olivat motivoituneita, aktiivisia ja valmiita ratkaisemaan käsityön ja koodin aiheuttamia haasteita! Craftlab kookoontui neljästi teknologiakasvattajan ohjaamalle paja-kerralle, joiden välissä jokainen sai itsenäisesti …

Lue lisää

Naisten reittejä datatalouteen – 4 menestystarinaa

Fuugin säätiön avustusten teemana vuonna 2022 on ”Hän koodaa, hen kodar”. Tähän teemaan uppoaa monimuotoisuus työyhteisöissä ja eri toimialoilla. Tästä syystä tuotettiin Jarkko Moilasen toimesta sarja datatalouden online-kahvitunteja. Kahvitunneilla 4 naista kertoi oman datatalouden menestys- ja kasvutarinansa. Jokaisen polku datatalouteen on erilainen ja jokainen sarjan tähti kertoikin kokemuksia aina uusista näkökulmista. Naisten tarinat datatalouden parissa …

Lue lisää

SynergyFinder 3.0 -sovellus usean lääkkeen yhdistelmien analysointiin

Kiitämme FUUG-säätiötä panoksesta SynergyFinder 3.0:n kehittämiseen. Se on vapaasti saatavilla oleva verkkosovellus, jonka avulla käyttäjät voivat vuorovaikutteisesti käsitellä, arvioida, tutkia, visualisoida ja raportoida luotettavimmista usean lääkkeen synergiaetuista usean annoksen lääkeyhdistelmätutkimuksista. Synergyfinderin uusi versio (versio 3) tarjoaa laskennallisen alustan nopeaan, luotettavaan ja toistettavaan lääkeyhdistelmäanalyysiin. Erityisesti SynergyFinder 3.0:ssa toteutettu uusi usean näytteen analyysivaihtoehto mahdollistaa luotettavamman lääkeyhdistelmäanalyysin sovelluksissa, …

Lue lisää

LibreOfficen suomennoksen tarkistamisen ja suomentamisen tukemisen tulokset

Fuugin säätiö myönsi minulle apurahan avoimen lähdekoodin toimisto-ohjelmisto LibreOfficen suomennoksen tarkistamista ja suomentamisen tukemista varten. Tavoitteeni oli tarkistaa LibreOfficen niiden osien suomennosta, joita ei ollut vielä käyty järjestelmällisesti läpi. Lisäksi tarkoitukseni oli laatia LibreOfficen suomentajille tyyliopas. Merkittävimmät järjestelmällistä tarkistusta kaipaavat LibreOfficen osat olivat hankkeen alkaessa Calc (taulukkolaskenta) ja Writer (tekstinkäsittely). Niiden suomennoksia olin toki tarkistanut …

Lue lisää

Kohan virkailijaliittymä

Koha-kirjastojärjestelmään virheenkorjauksia

Tänä vuonna tuli taas työskenneltyä Kohan virheiden korjailun parissa Fuugin säätiön avustuksella. Tässä pieni katsaus siihen mitä kaikkea tulikaan tehtyä. Ensin lukuja: projektin aikana ehdin tekemään noin 73 koodin katselmointia ja 17 koodimuutosta. Iso osa ajasta tuli käytettyä muiden tekemien korjausten ja refaktorointien katselmointiin. Iso joukko katselmoimistani bugiraporteista koski vanhasta Kohan C4-nimiavaruudesta uuteen olio-pohjaiseen Koha-avaruuteen …

Lue lisää

Avoin älykoti / loppuraportti

Vuonna 2020 Fuugin säätiön tuella aloitettu avoimen älykotiratkaisun kokoaminen helpoksi paketiksi -projekti on alkuperäisessä asussaan valmistunut, mutta isompana filosofisena työnä vasta täysin alussa. Näiden outojen aikojen – oli sitten kyse koronasta, etätyön kehittymisestä, maailman oudosta tilasta – aikana kodin merkitys ja sen digitalisaatio – älyllistyminen, on hyvin kovassa kasvussa. Tarve siis on kasvanut. Älykoti ja …

Lue lisää

Avoin datatuotteen koneluettava spesifikaatio versio 1.0 julkaistu

Loppuvuodesta 2021 Fuugin säätiö päätti rahoittaa avoimen datatuotteen spesifikaation luomista. Tarve spesifikaatiolle on noussut käytännön kokemusten kautta. Mihin spesifikaatiota tarvitaan? Datan avaaminen avoimena tai kaupallisessa tarkoituksessa on noussut suurempaan rooliin datatalouden kasvaessa. Dataa tarvitaan sovelluksissa ja järjestelmien välisiä operaatioita automatisoidessa. Dataa tarvitaan myös tekoälyn opettamiseen ja päätöksenteon tukena käytettävissä visualisoinneissa. Datan käytettävyys on yksi merkittävä …

Lue lisää